URDAIBAI est un exemple exceptionnel prouvant qu’au long de millions d’années la croûte terrestre a souffert des plissements et des fractures dus à l’action des forces provenant de l’activité magmatique qui sont encore en activité à l’intérieur de la Terre. L’érosion, provoquée par les agents atmosphériques et par d’autres phénomènes superficiels, a, elle aussi, collaboré à la formation du paysage actuel de la Réserve de la Biosphère. L’histoire géologique d’URDAIBAI est complexe et riche. Dans cette région, nous trouverons, par exemple, les affleurements du Jurassique en Biscaye.