La configuración del Observatorio responde a la necesidad de articular un sistema organizado y coherente para la recogida, almacenamiento, gestión, análisis y difusión de la información sobre biodiversidad.

En la CAPV existen numerosos productores de este tipo de datos, pertenecientes a administraciones, centros públicos y privados de investigación, empresas, asociaciones y particulares. Cada uno de estos estamentos gestiona individualmente sus registros, de manera que no siempre se encuentran disponibles bancos de datos o cartografía temática completas o actualizadas, que puedan ser útiles para otros usuarios.

Sin embargo, la demanda de información sobre biodiversidad es creciente, por parte de las administraciones cuya misión es conservar el patrimonio natural u ordenar el territorio, por parte de consultoras encargadas de proponer y estudiar la viabilidad ambiental de actividades, y por parte de educadores que precisan información genérica pero rigurosa.

En particular, la elaboración y estructuración del indicador de biodiversidad de la CAPV, constituido como un mecanismo de seguimiento de las tendencias y de evaluación de la efectividad de las políticas ambientales, debe reposar de forma evidente en la labor del observatorio.

El Observatorio, por tanto, debe tener en cuenta una doble perspectiva en su actuación:

• hacia los productores de información sobre biodiversidad, fomentando la implantación de redes de colaboración e integración y detectando aquellas deficiencias que sea conveniente cubrir
  
  
• hacia los usuarios potenciales, exportando análisis comprensivos y estudios en formatos y localizaciones accesibles