La acidificación de aguas continentales y/o marinas y de los suelos es un problema grave a nivel europeo. Su origen se sitúa en las grandes cantidades de óxidos de nitrógeno y azufre que se emiten a la atmósfera como resultado de la combustión de materias orgánicas para la obtención de energía y la emisión de estos compuestos en otras actividades industriales (fabricación de ácidos, papel, cemento) y el tráfico rodado. En la atmósfera, estos óxidos se hidratan, y dan lugar a una suspensión de partículas de agua ácida en torno a los núcleos de condensación existentes, en lo que se llama el mecanismo de deposición húmeda (lluvia ácida ). Existe también la posibilidad de que estos óxidos puedan llegar a los suelos y las aguas directamente desde las fuentes, dentro del mecanismo de deposición seca. Los mecanismos químicos de reacción atmosférica son complicados e intervienen muchos compuestos que en ocasiones no tienen carácter ácido, como es el caso del amoniaco. Una vez en el suelo o las aguas, la deposición ácida provoca la modificación de sus características químicas y la posterior afección a los ecosistemas existentes, ya que se pueden ver afectados procesos químicos fundamentales en algunas de las cadenas del ecosistema, dependiendo de la capacidad del medio para absorber el impacto. Otro efecto negativo de este problema ambiental se detecta en la corrosión de los materiales. En la Comunidad Autónoma del País Vasco se viene reflejando, desde el año 1986, un estudio sistemático de identificación y cuantificación del depósito ácido y su afección sobre poblaciones de Pinus radiata. Como conclusión, se ha podido documentar, a partir del estudio de retrotrayectorias (estudio de la trayectoria que siguen las masas nubosas procedentes del continente europeo cargadas con las emisiones de SO2 y NOx y que pueden afectar al medio en general), que la mayor incidencia de depósito ácido de origen antropogénico en la Comunidad Autónoma del País Vasco proviene del continente y que su efecto sobre las poblaciones arbóreas es desigual.