A continuación se enumeran una serie de limitaciones que presenta el trabajo, las cuales conviene conocer para una correcta utilización de sus resultados.

• Sólo puede emplearse para predecir la erosión laminar hídrica. No sirve para evaluar las pérdidas de suelos en barrancos, dentro de cauces de ríos, movimientos en masa, o para predecir erosión eólica.
  
  
• Los resultados obtenidos son aplicables para el territorio estudiado, es decir, para la Comunidad Autónoma de Euskadi, pero no tienen porqué ser válidos para otros territorios.
  
  
• La metodología aplicada garantiza sus resultados a una escala 1:25.000. Ampliar el tamaño de representación del mapa, si bien es posible informáticamente, puede inducir a errores.